Gli anticorpi anti endomisio sono auto anticorpi (anticorpi caratteristici delle malattie autoimmuni) diretti contro la mucosa intestinale. Questi anticorpi si trovano nel sangue di pazienti affetti da morbo celiaco, o da dermatite erpetiforme. Le malattie autoimmuni sono patologie in cui l'organismo produce anticorpi diretti contro i propri organi e tessuti, a causa della perdita o del malfunzionamento di particolari meccanismi di controllo.